Родился в посёлке Могойтуй Агинского Бурятского округа Забайкальского края. В 2006 году поступил в первый класс Ага-Хангильской средней школы. В юности Дылгыр защищал честь школы и родного села на спортивных соревнованиях. После школы с 2017 по 2018 год проходил срочную военную службу в г. Улан-Удэ. Затем с 2018 по 2020 год служил по контракту в г. Уссурийске. После армии в 2020 году Дылгыр поступил в Дальневосточное высшее общевойсковое командное училище имени Маршала Советского Союза К.К. Рокоссовского. За время учёбы был удостоен медали Министерства обороны РФ «За воинскую доблесть» II степени, а 7 декабря 2020 года получил медаль «За участие в военном параде в День Победы». Окончив училище в декабре 2023 года, он по распределению продолжил службу в г. Улан-Удэ. В 2025 году заключил новый контракт с Министерством обороны РФ для прохождения службы в зоне специальной военной операции.

Отважный офицер-разведчик 5 отдельной гвардейской танковой бригады Дылгыр Шойдоков принял свой последний бой в конце мая 2025 года на Южно-Донецком направлении.

Группа эвакуации во главе с лейтенантом Дылгыром Шойдоковым выдвинулась на мотоциклах к пункту сбора. При прохождении контрольной точки произошел подрыв и уничтожение мотоцикла группы эвакуации на дистанционно установленном противником минном поле. Лейтенант Дылгыр Шойдоков и его боевой товарищ были тяжело ранены. Военнослужащие самостоятельно оказали друг другу первую медицинскую помощь. Оказалось, что боец из группы Дылгыра Шойдокова не способен самостоятельно двигаться. Командир группы эвакуации проявляя мужество и стойкость ползком перенес раненого бойца в прилегающую лесополосу и передал его фельдшеру соседнего подразделения. Оценив ситуацию, офицер отправил раненого товарища в сопровождении фельдшера в полевой медицинский пункт, а сам остался прикрывать отход и огнем из стрелкового оружия уничтожил 15 украинских FPV-дронов и 3 БПЛА квадрокоптерного типа, пытавшихся помешать эвакуации. Ценой собственной жизни, офицер спас боевых товарищей. За этот подвиг лейтенант Дылгыр Шойдоков представлен к званию Героя России.

Медаль «За участие в военном параде в День Победы»
Медаль «За воинскую доблесть» II степени