Родился в поселке Агинское Агинского Бурятского автономного округа. Учился в Урда-Агинской СОШ и школе №32 в Иркутске. После школы Балдан Баирович поступил на факультет военной разведки Новосибирского высшего военного командного ордена Жукова училище (НВВКУ). Защищал честь училища в соревнованиях по армейскому рукопашному бою. В 2020 году после окончания училища распределился в Восточный военный округ, сначала в г. Уссурийск (служил командиром взвода снайперов в 60 отдельной мотострелковой Краснознаменной бригаде), а затем через год – в 5 гвардейскую танковую Тацинскую бригаду (г. Улан-Удэ).

На СВО – с ее первых дней. 30 марта 2022 года во время специальной военной операции Балдан Цыдыпов и его товарищи попали во вражескую засаду в лесном массиве. Российскую колонну замыкал взвод Балдана Цыдыпова, который первым оказался под массированным вражеским огнем. В неравном бою, который длился два часа, старший лейтенант, командир мотострелкового взвода Балдан Цыдыпов принял огонь на себя и спас 150 боевых товарищей. Тогда он лично уничтожил множество неонацистов и бронетехнику противника из подбитого БМП-2. При этом Балдан Баирович, получив множество ранений, выжил, перенес 14 операций, из его тела врачи вытащили около 2 кг осколков.

Весной 2022 года общественники Бурятии в лице матери Героя России Анатолия Коробенкова – председателя улан-удэнского отделения РОО «Женщины Бурятии» Натальи Коробенковой и атамана улан-удэнского городского казачьего общества «Верхнеудинская станица» Дениса Леонова подготовили ходатайство на имя Главы Бурятии о решении вопроса по присвоению звания Героя России Балдану Цыдыпову. Они же объявили сбор подписей под обращением. Патриотическую инициативу поддержал Глава Бурятии Алексей Цыденов. Также откликнулись общественные деятели, политики, в том числе сенатор Александр Варфоломеев, на тот момент руководитель БРО ВООВ «Боевое Братство», а ныне парламентарий Жамбал-Жамсо Жанаев, депутат НХ РБ Игорь Марковец и в то время депутат Народного Хурала Республики Бурятия Сергей Миронович Пашинский, председатель правления РОО «Ассоциация народов Бурятии «Дом дружбы» Сажида Баталова.

Глава Бурятии в апреле 2022 года официально обратился к Сергею Шойгу с просьбой присвоить звание Героя России лейтенанту Балдану Цыдыпову. А затем 31 мая того же года Алексей Цыденов во время рабочей встречи с Президентом РФ Владимиром Путиным, которая прошла в режиме видеоконференцсвязи, обратился к нему с просьбой поддержать представление Минобороны РФ о присвоении звания Героя России Балдану Цыдыпову. Владимир Путин поддержал эту инициативу. Указом (закрытым) Президента РФ от 11 июня 2022 года Балдану Цыдыпову присвоено звание Героя России. 29 июня 2022 года Сергей Шойгу приехал в Центральный военный клинический госпиталь имени П.В. Мандрыка. И вручил Золотую Звезду героическому гвардейцу, командиру мотострелкового взвода.

Герой России Балдан Цыдыпов продолжил славные боевые традиции своих предков. Так, прадед Балдана – Санжин Цыдып во время Великой Отечественной войны погиб на Украине. Два прадеда Балдана по материнской линии дошли до Берлина – Цыбэнэй Гомбо и Аюшиев Цыбенжаб.

В декабре 2022 года Балдану Баировичу Цыдыпову присвоено звание Почетного гражданина Агинского района Забайкальского края. В феврале 2023 года бюст Героя установили в НВВКУ. В конце 2024 года Балдан Цыдыпов назначен на должность директора департамента по патриотической работе в Российском обществе «Знание».

Герой Российской Федерации
Орден Мужества